RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409617.5

SERF2-208, Transcript of small EDRK-rich factor 2, human

TSL 2

Gene SERF2, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF2-208	ENST00000409617	MID1	O15344	667 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	BNIP3L	O60238	219 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	FTCD	O95954	541 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	IL1B	P01584	269 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PRNP	P04156	253 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CTSL	P07711	333 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MX2	P20592	715 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CCNC	P24863	283 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CD6	P30203	668 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PTPN7	P35236	360 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	RHOA	P61586	193 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MYLK3	Q32MK0	819 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PLK5	Q496M5	336 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CACUL1	Q86Y37	369 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ALG3	Q92685	438 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	VOPP1	Q96AW1	172 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PSKH2	Q96QS6	385 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PHOX2B	Q99453	314 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	IL36A	Q9UHA7	158 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CST8	O60676	142 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	KRT10	P13645	584 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	BCKDHB	P21953	392 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PSMD8	P48556	350 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CSNK1D	P48730	415 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	NR2C2	P49116	596 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ZNF33A	Q06730	810 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ARSI	Q5FYB1	569 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	KBTBD6	Q86V97	674 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	HDAC11	Q96DB2	347 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	SEPT3	Q9UH03	358 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	FZD4	Q9ULV1	537 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		15	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617		A0A1W2PP55	124 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	RNF103	O00237	685 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MATN3	O15232	486 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MAP3K13	O43283	966 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ZSCAN12	O43309	604 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	LEFTY1	O75610	366 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	RHOBTB1	O94844	696 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MAP3K6	O95382	1288 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	IGSF6	O95976	241 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PYGM	P11217	842 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TGM2	P21980	687 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	DRD3	P35462	400 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CETN2	P41208	172 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	RENBP	P51606	427 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	METAP1	P53582	386 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ADCY2	Q08462	1091 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PDK1	Q15118	436 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ELF2	Q15723	593 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	KAZN	Q674X7	775 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PMS2CL	Q68D20	193 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	BBS12	Q6ZW61	710 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TEX26	Q8N6G2	289 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TRIM58	Q8NG06	486 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	MAML1	Q92585	1016 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	OLFM3	Q96PB7	478 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SERF2-208	ENST00000409617	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		14.99	□□□□□ -0.01

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