RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409205.5

SUMO1-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SUMO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-205	ENST00000409205	PEX12	O00623	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	MDM4	O15151	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	IFNA2	P01563	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CNTF	P26441	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PTPN9	P43378	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TLE2	Q04725	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	STAM	Q92783	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ANP32C	O43423	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CREB3	O43889	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PYGL	P06737	847 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TNFSF8	P32971	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	RPE65	Q16518	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SPTLC2	O15270	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	STRN	O43815	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMCC1	O94876	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CD72	P21854	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	EYA2	O00167	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	HBP1	O60381	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CBX6	O95503	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	KLKB1	P03952	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	POLD2	P49005	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	CLCNKB	P51801	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	DPP10	Q8N608	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	MROH8	Q9H579	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUMO1-205	ENST00000409205	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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