RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 IGSF6O95976 241 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 MX2P20592 715 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 RAD51Q06609 339 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 FAM124AQ86V42 546 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 TP53INP2Q8IXH6 220 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 HDDC3Q8N4P3 179 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 CHST14Q8NCH0 376 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 EXD1Q8NHP7 514 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 LRIG1Q96JA1 1093 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 DYRK4Q9NR20 520 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 NCDNQ9UBB6 729 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 FZD4Q9ULV1 537 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PP55 124 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 MFSD11O43934 449 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 POP4O95707 220 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 TFDP2Q14188 446 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 TMCO4Q5TGY1 634 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 MFSD7Q6UXD7 560 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 RFX6Q8HWS3 928 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC50Q8IVM0 306 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 RUBCNQ92622 972 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 FOXJ1Q92949 421 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 PPP1R16AQ96I34 528 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 SARDHQ9UL12 918 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-204ENST00000400919 CHD5Q8TDI0 1954 aa27.89■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MAFKO60675 156 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 RETP07949 1114 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GARSP41250 739 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CDKN2BP42772 138 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GALNT2Q10471 571 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CYTH1Q15438 398 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MYLK3Q32MK0 819 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 ARSIQ5FYB1 569 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SLC9A4Q6AI14 798 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 TMEFF1Q8IYR6 380 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 BBS5Q8N3I7 341 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 UBL4BQ8N7F7 174 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CADM4Q8NFZ8 388 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 PDLIM2Q96JY6 352 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 HINFPQ9BQA5 517 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GFRA3O60609 400 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 LEFTY1O75610 366 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CTSLP07711 333 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CTNNA2P26232 953 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 CETN2P41208 172 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 RENBPP51606 427 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 RWDD2BP57060 319 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 TFDP3Q5H9I0 405 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 ASCL5Q7RTU5 278 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 AADATQ8N5Z0 425 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 KRT35Q92764 455 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GPR174Q9BXC1 333 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SEPT3Q9UH03 358 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 KRIT1O00522 736 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MARCKSL1P49006 195 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 COPS2P61201 443 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 LBRQ14739 615 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 TAZQ16635 292 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 LZTFL1Q9NQ48 299 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 HEY1Q9Y5J3 304 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 WASF2Q9Y6W5 498 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SLC7A4O43246 635 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GBE1Q04446 702 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 GRM3Q14832 879 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 POM121L1PQ3SYA9 428 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 PLD5Q8N7P1 536 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 OR6K2Q8NGY2 324 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 HAUS2Q9NVX0 235 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 DTLQ9NZJ0 730 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 LHX3Q9UBR4 397 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SERGEFQ9UGK8 458 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 MYO15AQ9UKN7 3530 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC72A6NJI9 287 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 SEMA4FO95754 770 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 ACSL1P33121 698 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-204ENST00000400919 DPP6P42658 865 aa27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms