RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 AP4S1Q9Y587 144 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN8A6NHC0 703 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPR25O00155 361 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TADA2AO75478 443 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STAMBPO95630 424 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALT4O96024 378 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PIGRP01833 764 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APOA4P06727 396 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KITP10721 976 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MLNP12872 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARNTP27540 789 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HMOX2P30519 316 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MYL6P60660 151 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CTBSQ01459 385 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SP2Q02086 613 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PTSQ03393 145 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CRHR2Q13324 411 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB3Q13509 450 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 INPP5AQ14642 412 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MBLAC2Q68D91 279 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HACE1Q8IYU2 909 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP36Q96G28 342 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CAPNS2Q96L46 248 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCT7Q99832 543 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APOL6Q9BWW8 343 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DRC3Q9H069 523 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RRN3Q9NYV6 651 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LRCH4O75427 683 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BANF1O75531 89 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OR6B1O95007 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BMP10O95393 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 H6PDO95479 791 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZBED1O96006 694 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ACRP10323 421 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ME2P23368 584 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CD151P48509 253 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STAT5BP51692 787 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DYNLT1P63172 113 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPLD1P80108 840 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRR20EP86478 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRR20CP86479 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRR20DP86480 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRR20BP86481 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRR20AP86496 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCEA2Q15560 299 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MYLK3Q32MK0 819 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC14Q49A88 953 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZNX1 250 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM35AQ86V20 835 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 USP6NLQ92738 828 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BORCS5Q969J3 196 aa7.31□□□□□ -1.24
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