RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR8H2Q8N162 312 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 FRMD1Q8N878 549 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZMIZ2Q8NF64 920 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 ETNPPLQ8TBG4 499 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDB2Q92466 427 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGAP2Q99490 1192 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIMREGQ9BSJ6 248 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 LHPPQ9H008 270 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDCL3Q9H2J4 239 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIPK3Q9H422 1215 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 BABAM1Q9NWV8 329 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA1456Q9P272 454 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC17A6Q9P2U8 582 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 DHDHQ9UQ10 334 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 WNT6Q9Y6F9 365 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 A6NNC1 897 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB2A8KAH6 182 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTBD19C9JJ37 291 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 K7ENM7 598 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RHODO00212 210 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SGPL1O95470 568 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCGB1D1O95968 90 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINC1P01008 464 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 POU1F1P28069 291 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TACR3P29371 465 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL3P36405 182 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPP6P42658 865 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXCR3P49682 368 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLCN3P51790 818 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 OAZ1P54368 228 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 F2RL1P55085 397 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 OLR1P78380 273 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC18A2Q05940 514 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAMB3Q13751 1172 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RUNX2Q13950 521 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FHL2Q14192 279 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB2Q16082 182 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C5orf22Q49AR2 442 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP78Q5JTW2 689 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASPHD1Q5U4P2 390 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC3Q5W041 872 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDC73Q6P1J9 531 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR5BQ86VZ2 330 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPSM1Q86YR5 675 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00346Q8IVM7 164 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CADM3Q8N126 398 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAR1Q8WVX9 515 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASB2Q96Q27 587 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 BBS4Q96RK4 519 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERINC2Q96SA4 455 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIMP4Q99727 224 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFT27Q9BW83 186 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC13Q9H3R2 512 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIF9Q9HAQ2 790 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC6A13Q9NSD5 602 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPP6Q9NZW5 540 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLG2Q9UHN1 485 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PACSIN3Q9UKS6 424 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNFSF13BQ9Y275 285 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIPT2A6NK58 231 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 A8MV72 311 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2Q2LH0YL09 131 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms