RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 VPS45Q9NRW7 570 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 HAUS5O94927 633 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 CBX6O95503 412 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ABCG1P45844 678 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 RASSF2P50749 326 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 PARP15Q460N3 678 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 PSMG2Q969U7 264 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM237Q96Q45 408 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 NT5MQ9NPB1 228 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 TREX1Q9NSU2 369 aa20.35■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ADAM12O43184 909 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 RAMP2O60895 175 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SERPINE1P05121 402 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 C2P06681 752 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 GRK2P25098 689 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ARNTP27540 789 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 MAPKAPK2P49137 400 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB16Q05516 673 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 UGP2Q16851 508 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 USP41Q3LFD5 358 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF358Q9NW07 568 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.34■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SIN3BO75182 1162 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ATP6V1G2O95670 118 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 GMPRP36959 345 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 IL10RBQ08334 325 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 GRM3Q14832 879 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 DLG2Q15700 870 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 WWP1Q9H0M0 922 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.33■□□□□ 0.85
SERBP1-201ENST00000361219 VAPBO95292 243 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PAMP19021 973 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CHRNA4P43681 627 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SERINC3Q13530 473 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.33■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 E2F8A0AVK6 867 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MMP2P08253 660 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CPA3P15088 417 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TACR2P21452 398 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 GABRB3P28472 473 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC1A6P48664 564 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PCSK7Q16549 785 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 C5orf22Q49AR2 442 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ITM2AO43736 263 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 AHSGP02765 367 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 OR1E1P30953 314 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 OR1D2P34982 312 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CD86P42081 329 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MAXP61244 160 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 IRF9Q00978 393 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 KRT72Q14CN4 511 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.842e-9■■■■□ 20
SERBP1-201ENST00000361219 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms