RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CYS1Q717R9 158 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 BBS5Q8N3I7 341 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM159BA6NKW6 160 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ALDH1A2O94788 518 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 POLBP06746 335 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MMP2P08253 660 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 DUSP6Q16828 381 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 DDI1Q8WTU0 396 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SEPT3Q9UH03 358 aa24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CBX4O00257 560 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 INHBAP08476 426 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MPPE1Q53F39 396 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FSCBQ5H9T9 825 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MPP7Q5T2T1 576 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TRABD2AQ86V40 505 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 LRRC6Q86X45 466 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PPM1NQ8N819 430 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TADA1Q96BN2 335 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 NOTCH4Q99466 2003 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 A6NNZ2 444 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF197O14709 1029 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MUSKO15146 869 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ATP9BO43861 1147 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TPH1P17752 444 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 KRT15P19012 456 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 NRIP1P48552 1158 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PCSK7Q16549 785 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MFN1Q8IWA4 741 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 BHMTQ93088 406 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TTC17Q96AE7 1141 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 GDF15Q99988 308 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MGME1Q9BQP7 344 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TDP1Q9NUW8 608 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MAGEB16A2A368 324 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RANBP10Q6VN20 620 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TMEM135Q86UB9 458 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SEMA3CQ99985 751 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SENP1Q9P0U3 644 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SOX13Q9UN79 622 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 USP1O94782 785 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CEBPBP17676 345 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 GNGT1P63211 74 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 GUCY1A3Q02108 690 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RIN3Q8TB24 985 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PSKH2Q96QS6 385 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PIDD1Q9HB75 910 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 VPS28Q9UK41 221 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PRAMEF12O95522 483 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CREB1P16220 341 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CSKP41240 450 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 PPARDQ03181 441 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RNF43Q68DV7 783 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CES3Q6UWW8 571 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 EPOPA6NHQ4 379 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 SNAP91O60641 907 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CYBBP04839 570 aa24.7■■□□□ 1.55
GTF2E2-201ENST00000355904 BRAFP15056 766 aa24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms