RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERINC3Q13530 473 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPYSL2Q16555 572 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARSIQ5FYB1 569 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNT1Q5JUK3 1230 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAYNQ6UX15 382 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF354CQ86Y25 554 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 VOPP1Q96AW1 172 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A18Q96N87 628 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHP1Q99653 195 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEPHQ9BQS7 1158 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOCK9Q9BZ29 2069 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GVT2 93 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LATO43561 262 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJB3O75712 270 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCC1O94876 653 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERCC2P18074 760 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIA4P48058 902 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDST2P52849 883 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPYSQ14117 519 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFMIDQ63HM1 303 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPP6Q8IY26 295 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPWQ8N729 165 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6K2Q8NGY2 324 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM5Q9C035 493 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEF6Q9H4E7 631 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZWILCHQ9H900 591 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDFQ9HBH1 243 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3EA0A087X179 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3LB9A6J9 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPHN1O60890 802 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK5O95279 499 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3HP0C7X1 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 RARAP10276 462 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNA4P22459 653 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 GKP32189 559 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCAR3P49019 387 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 BOLA3Q53S33 107 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM69Q86WT6 500 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE8Q86YQ8 564 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNGA4Q8IV77 575 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 NETO2Q8NC67 525 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPH1Q92598 858 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R16AQ96I34 528 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC8Q9BY41 377 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBSNQ9H1K0 784 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYRK4Q9NR20 520 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTLC3Q9NUV7 552 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 DONSONQ9NYP3 566 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BRJ5 948 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1FO00160 1098 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAPK3O43293 454 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR1B10O60218 316 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 H2AFZP0C0S5 128 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB7P26010 798 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEAD4Q15561 434 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF19Q2TAC6 998 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 H2AFVQ71UI9 128 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEKT4Q8WW24 435 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL21RQ9HBE5 538 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 PREBQ9HCU5 417 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 UVRAGQ9P2Y5 699 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHX3Q9UBR4 397 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms