RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TPP1O14773 563 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 GJB3O75712 270 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 GNA12Q03113 381 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ITIH4Q14624 930 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IL21Q9HBE4 155 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PDFQ9HBH1 243 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PLLPQ9Y342 182 aa23.09■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CSPG5O95196 566 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TNK2Q07912 1038 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRF1Q5T601 910 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA21Q7Z572 469 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRN2Q92932 1015 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYND15Q9H091 742 aa23.08■■□□□ 1.29
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VSTM4-201ENST00000298454 MUSKO15146 869 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 GRTP1Q5TC63 336 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC8Q6A555 127 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IL31Q6EBC2 164 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.08■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0754O94854 1291 aa23.07■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 POTEHQ6S545 545 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GPR65Q8IYL9 337 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2A3Q93084 1043 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 RBBP8Q99708 897 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEH1Q9H213 219 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MAFFQ9ULX9 164 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 CXCL14O95715 111 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ABCG1P45844 678 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PDE1BQ01064 536 aa23.07■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 TMC7Q7Z402 723 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ITIH5Q86UX2 942 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SPON2Q9BUD6 331 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.07■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.07■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 CREMQ03060 361 aa23.06■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 INSL6Q9Y581 213 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.06■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 ARNT2Q9HBZ2 717 aa23.06■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F8P98187 520 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 FPGSQ05932 587 aa23.05■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF235Q14590 738 aa23.05■■□□□ 1.28
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VSTM4-201ENST00000298454 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 DCLK2Q8N568 766 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC63Q8NA47 563 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MECRQ9BV79 373 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 STK39Q9UEW8 545 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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