RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 HHIPQ96QV1 700 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 EBF1Q9UH73 591 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 AMACRQ9UHK6 382 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CTAGE9A4FU28 777 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ALDH1A2O94788 518 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IGSF6O95976 241 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FGGP02679 453 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CCNB1P14635 433 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 GABRG2P18507 467 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MMP13P45452 471 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CSNK1DP48730 415 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RENBPP51606 427 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RHOAP61586 193 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 AP1B1Q10567 949 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SLC45A4Q5BKX6 768 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 STK40Q8N2I9 435 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 COG1Q8WTW3 980 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 OR8D1Q8WZ84 308 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FAM129BQ96TA1 746 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IL12RB2Q99665 862 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MGME1Q9BQP7 344 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TNKS2Q9H2K2 1166 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CACNA1HO95180 2353 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MUSKO15146 869 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MTSS1O43312 755 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RBP3P10745 1247 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFV2P19404 249 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CR2P20023 1033 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF235Q14590 738 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ALG1LQ6GMV1 187 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ANO7Q6IWH7 933 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS6Q8IU80 811 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CHST14Q8NCH0 376 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ACTRT1Q8TDG2 376 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NELL1Q92832 810 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 VOPP1Q96AW1 172 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PPM1HQ9ULR3 514 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.44□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NUMA1Q14980 2115 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 H7C0C1 242 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 KCNK1O00180 336 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 BNIP3LO60238 219 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PRNPP04156 253 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TUBB4AP04350 444 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNA3P32297 505 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RGRP47804 291 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ATP5OP48047 213 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB16Q05516 673 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB17Q13105 803 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ANGPT1Q15389 498 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LONRF2Q1L5Z9 754 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SYT10Q6XYQ8 523 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PGBD5Q8N414 524 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TMIEQ8NEW7 156 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HMGB4Q8WW32 186 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 EXOC2Q96KP1 924 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 VAT1Q99536 393 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms