RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ACOT9Q9Y305 439 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 NUP205Q92621 2012 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TXNDC9O14530 226 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CCL15Q16663 113 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 UGP2Q16851 508 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 LIN52Q52LA3 116 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 NXNQ6DKJ4 435 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TSGA13Q96PP4 275 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SATB1Q01826 763 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TLK2Q86UE8 772 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 LSMEM2Q8N112 164 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 RCN3Q96D15 328 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 BTBD9Q96Q07 612 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 XPR1Q9UBH6 696 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TARM1B6A8C7 271 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DFFAO00273 331 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CACNG3O60359 315 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DLX3O60479 287 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DNAJB1P25685 340 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 THOP1P52888 689 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 GRM2Q14416 872 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PDK3Q15120 406 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM198Q66K66 360 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TAC4Q86UU9 113 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 STON2Q8WXE9 905 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 VPS28Q9UK41 221 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CDH9Q9ULB4 789 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 VAPBO95292 243 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 RAB10P61026 200 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MPP1Q00013 466 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 FOLH1Q04609 750 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CTBP1Q13363 440 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF460Q14592 562 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 POU6F1Q14863 301 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 EPHX2P34913 555 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CLCNKBP51801 687 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF33AQ06730 810 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 FLOT2Q14254 428 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PIGGQ5H8A4 983 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 IPMKQ8NFU5 416 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 NXNL1Q96CM4 212 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CAPN8A6NHC0 703 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 HAS3O00219 553 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CFLARO15519 480 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PGK1P00558 417 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MYL3P08590 195 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CCNCP24863 283 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 GSTT1P30711 240 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 POLD2P49005 469 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 HERC3Q15034 1050 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CEP97Q8IW35 865 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MARK4Q96L34 752 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 GCNAQ96QF7 691 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 STMN1P16949 149 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.9■■□□□ 1.26
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