RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 ADH1CP00326 375 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 MARCKSL1P49006 195 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CDK18Q07002 472 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 USP7Q93009 1102 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SPACA7Q96KW9 195 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SPATA31D3P0C874 917 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TAF10Q12962 218 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PTPRNQ16849 979 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FGF19O95750 216 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 DHFR2Q86XF0 187 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SLIT3O75094 1523 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 HTR1BP28222 390 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PCYT1AP49585 367 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TLE6Q9H808 572 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.47■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 INPP4BO15327 924 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FTH1P02794 183 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PRELID2Q8N945 189 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TMCO1Q9UM00 188 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PAGE1O75459 146 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 STRADAQ7RTN6 431 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SYBUQ9NX95 663 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PSME2Q9UL46 239 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SEPT4O43236 478 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 DCXO43602 365 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PIRTP0C851 137 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TSHRP16473 764 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.46■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 COX7A2P14406 83 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NAGLUP54802 743 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 GNA13Q14344 377 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NCF4Q15080 339 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 BSNDQ8WZ55 320 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SNX6Q9UNH7 406 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NUP107P57740 925 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TAS2R40P59535 323 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ZNF544Q6NX49 715 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SNX32Q86XE0 403 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SERPINB3P29508 390 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SPIDRQ14159 915 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 BDH2Q9BUT1 245 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FGBP02675 491 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FGF1P05230 155 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LBPP18428 481 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms