RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TRABD2AQ86V40 505 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PIGZQ86VD9 579 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NRCAMQ92823 1304 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CALCAP01258 141 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA2BP08514 1039 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRAP18433 802 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GABRB2P47870 512 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TNK2Q07912 1038 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2A13Q16696 494 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 WSCD1Q658N2 575 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 IQCKQ8N0W5 287 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CCNB1P14635 433 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PAX3P23760 479 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 WEE1P30291 646 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NEK10Q6ZWH5 1172 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 HDHD2Q9H0R4 259 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CDH9Q9ULB4 789 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH8O95206 1070 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RAB10P61026 200 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 QRFPRQ96P65 431 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TGFB1I1O43294 461 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 COX7A2P14406 83 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NOS3P29474 1203 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FEN1P39748 380 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GRIA3P42263 894 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CAPSQ13938 189 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CDC73Q6P1J9 531 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KLQ9UEF7 1012 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 USP45Q70EL2 814 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 BBS4Q96RK4 519 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD5O75356 428 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TTC7BQ86TV6 843 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TFEBP19484 476 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 COX10Q12887 443 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 BNIP2Q12982 314 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 AAGABQ6PD74 315 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SNX6Q9UNH7 406 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ANPEPP15144 967 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GSSP48637 474 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NR1H2P55055 460 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 IRF8Q02556 426 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ALG3Q92685 438 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KRT36O76013 467 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CD86P42081 329 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK8P45983 427 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RINLQ6ZS11 566 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PPP3R2Q96LZ3 170 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 55.7
CCSAP-201ENST00000284617 TTPAP49638 278 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 LIPMQ5VYY2 423 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NBNO60934 754 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY1B2O75343 617 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 LYPLA2O95372 231 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FYNP06241 537 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PDK3Q15120 406 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO30Q8TB52 745 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 UROC1Q96N76 676 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RPL5P46777 297 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PSEN1P49768 467 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms