RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MIEF2Q96C03 454 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TIFAQ96CG3 184 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 S100A13Q99584 98 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC18Q9H819 358 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 PXDNQ92626 1479 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CACNA2D1P54289 1103 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MAMLD1Q13495 774 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RFX4Q33E94 735 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ENKURQ8TC29 256 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HASPINQ8TF76 798 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EDEM1Q92611 657 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ART4Q93070 314 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TPD52L3Q96J77 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ASAH2Q9NR71 780 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 GMEB1Q9Y692 573 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 PSMD10O75832 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OTCP00480 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TGFBR2P37173 567 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GPD2P43304 727 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RFX3P48380 749 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DACT2Q5SW24 774 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LRRC19Q9H756 370 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ARL15Q9NXU5 204 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 FGD3Q5JSP0 725 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MACC1Q6ZN28 852 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 AP3S1Q92572 193 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KAT2BQ92831 832 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CDCA5Q96FF9 252 aa7.29□□□□□ -1.24
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