RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 RBBP8Q99708 897 aa16.98■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.98■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 LAMC2Q13753 1193 aa16.97■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 PCNAP12004 261 aa16.96■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 TPSAB1Q15661 275 aa16.96■□□□□ 0.31
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CTDP1-201ENST00000075430 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 BCO2Q9BYV7 579 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDP1-201ENST00000075430 H6PDO95479 791 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDP1-201ENST00000075430 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTDP1-201ENST00000075430 LRPAP1P30533 357 aa16.95■□□□□ 0.3
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