RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	HTR7	P34969	479 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SERINC3	Q13530	473 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ENPP2	Q13822	863 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CRY1	Q16526	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634		Q6ZVU0	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	GABRG3	Q99928	467 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ENC1	O14682	589 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SIN3B	O75182	1162 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TDGF1	P13385	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CD46	P15529	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	METAP1	P53582	386 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	OXCT1	P55809	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TAZ	Q16635	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PRSS33	Q8NF86	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634		H0Y858	1186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	FANCG	O15287	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KDELR3	O43731	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ASL	P04424	464 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	GK	P32189	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ETFB	P38117	255 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CXCL12	P48061	93 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	NDST2	P52849	883 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	COPA	P53621	1224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DLG2	Q15700	870 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PARP15	Q460N3	678 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ACD	Q96AP0	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	TIMM44	O43615	452 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CST8	O60676	142 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PEX11B	O96011	259 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	GABRG2	P18507	467 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RGR	P47804	291 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	FNTB	P49356	437 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CCR3	P51677	355 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63

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