RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-215ENST00000637266 PCNAP12004 261 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CASP4P49662 377 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ELP6Q0PNE2 266 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 IRGQQ8WZA9 623 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 TEKT5Q96M29 485 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 APOL5Q9BWW9 433 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ADAMDEC1O15204 470 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HDAC3O15379 428 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 IL1R1P14778 569 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HALP42357 657 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FAM228AQ86W67 206 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM192Q8IY95 271 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF276Q8N554 614 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ITCHQ96J02 903 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 AIFM3Q96NN9 605 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 MEMO1Q9Y316 297 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NR5A2O00482 541 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FOXM1Q08050 763 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NR1D2Q14995 579 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 RNF135Q8IUD6 432 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FBXO32Q969P5 355 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CDH19Q9H159 772 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 H3BNH8 94 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FGFR1P11362 822 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ATP4AP20648 1035 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 MTMR2Q13614 643 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NR6A1Q15406 480 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM169Q96HH4 297 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ANXA5P08758 320 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HKDC1Q2TB90 917 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PNKPQ96T60 521 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 INTS13Q9NVM9 706 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 H3BUI4 141 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ZBTB14O43829 449 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ASMTLO95671 621 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CCNE2O96020 404 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SERPINA3P01011 423 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 GSTT2BP0CG30 244 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 NR2F6P10588 404 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ARFIP1P53367 373 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 PITPNAQ00169 270 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 ALLCQ8N6M5 410 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 CHP1Q99653 195 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 KIFC1Q9BW19 673 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.09□□□□□ -1.27
SCN2A-215ENST00000637266 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 M0QYT0 321 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 PDCD5O14737 125 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 UGT2B15P54855 530 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 LIPMQ5VYY2 423 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 ADCK2Q7Z695 626 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 MDM1Q8TC05 714 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 USP7Q93009 1102 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 LHX5Q9H2C1 402 aa7.09□□□□□ -1.28
SCN2A-215ENST00000637266 GALNT8Q9NY28 637 aa7.09□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms