RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636093.1

U6.111-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.111-201ENST00000636093 SMC1BQ8NDV3 1235 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SLC35F5Q8WV83 523 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ZDHHC12Q96GR4 267 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SERAC1Q96JX3 654 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ABHD10Q9NUJ1 306 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TUBD1Q9UJT1 453 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 KCNS2Q9ULS6 477 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa-0.67□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 A0A1B0GVM2 712 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 GPRIN2O60269 458 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 DFNA5O60443 496 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CIDEAO60543 219 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 C9P02748 559 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 KLRC1P26715 233 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PIK3R1P27986 724 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PRKAR1BP31321 381 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 UQCRC1P31930 480 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 HNF4AP41235 474 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 OCRLQ01968 901 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SPOCK1Q08629 439 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 AMOTQ4VCS5 1084 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 XKR3Q5GH77 459 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 FAM69BQ5VUD6 431 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 METTL25Q8N6Q8 603 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PPM1NQ8N819 430 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 Q8N9L7 120 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SUMF1Q8NBK3 374 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 OR52N4Q8NGI2 321 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TMEM163Q8TC26 289 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 BPIFB1Q8TDL5 484 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 NRG4Q8WWG1 115 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 BADQ92934 168 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PPP2R3CQ969Q6 453 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TMEM19Q96HH6 336 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 ST6GAL2Q96JF0 529 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 VPS50Q96JG6 964 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CLPTM1LQ96KA5 538 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 BACH2Q9BYV9 841 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TRIM2Q9C040 744 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PANK3Q9H999 370 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SAP30LQ9HAJ7 183 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CNNM1Q9NRU3 951 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TNNQ9UQP3 1299 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa-0.68□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CCDC85CA6NKD9 419 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SERPINE3A8MV23 424 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 LCKP06239 509 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 HLA-DOBP13765 273 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 NFKBIAP25963 317 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PRDX5P30044 214 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 RPP30P78346 268 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PAX8Q06710 450 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 DNASE1L3Q13609 305 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 EFNB3Q15768 340 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TOR2AQ5JU69 321 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 FFAR4Q5NUL3 377 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PDSS1Q5T2R2 415 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 MIGA2Q7L4E1 593 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 FAM90A1Q86YD7 464 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 HERC6Q8IVU3 1022 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SPARTQ8N0X7 666 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CPA6Q8N4T0 437 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 LRRC57Q8N9N7 239 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 FCAMRQ8WWV6 532 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TANKQ92844 425 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 SLC5A5Q92911 643 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 KAT5Q92993 513 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 BCANQ96GW7 911 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 MESP1Q9BRJ9 268 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 LRRC1Q9BTT6 524 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 LAT2Q9GZY6 243 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.111-201ENST00000636093 MYNNQ9NPC7 610 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms