RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558673.1

KLF13-204, Transcript of Kruppel like factor 13, human

TSL 3

Gene KLF13, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLF13-204	ENST00000558673	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SYT5	O00445	386 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	ACKR2	O00590	384 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	DDAH2	O95865	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	FCGR1A	P12314	374 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SERPINF1	P36955	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CDK7	P50613	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CDH12	P55289	794 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	MST1R	Q04912	1400 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673		A0A1B0GUV1	79 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	LDB3	O75112	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	ACP5	P13686	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CHN1	P15882	459 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	NUDT6	P53370	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	BNC1	Q01954	994 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	COASY	Q13057	564 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	LHPP	Q9H008	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLF13-204	ENST00000558673	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	ASAP2	O43150	1006 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SOX30	O94993	753 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	CYP4B1	P13584	511 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	NAGA	P17050	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	AMT	P48728	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	CLCNKB	P51801	687 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	WBP1	Q96G27	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	ARSA	P15289	507 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	DPP6	P42658	865 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KLF13-204	ENST00000558673	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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