RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HSPB6	O14558	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	NTN1	O95631	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	KLKB1	P03952	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DPP6	P42658	865 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MAPK9	P45984	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CHRND	Q07001	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MROH8	Q9H579	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HBP1	O60381	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TSPAN3	O60637	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CHRNB2	P17787	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP3CC	P48454	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CLCNKB	P51801	687 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RPE65	Q16518	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	BECN2	A8MW95	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ADA	P00813	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PYGL	P06737	847 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	AVPR1A	P37288	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SELENOV	P59797	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TRAF1	Q13077	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DUSP6	Q16828	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591		Q6ZTK2	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HSPH1	Q92598	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PER2	O15055	1255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SERPINC1	P01008	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CYP1A2	P05177	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RASSF2	P50749	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TDG	Q13569	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR18	Q14330	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ME3	Q16798	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CD180	Q99467	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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