RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	SERPINF1	P36955	418 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	AVPR1A	P37288	418 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ART1	P52961	327 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	AP2B1	P63010	937 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ALF	Q53S48	1182 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	NME8	Q8N427	588 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CPT1B	Q92523	772 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PIGS	Q96S52	555 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CYP21A2	P08686	494 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GRK6	P43250	576 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PMS2	P54278	862 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	BIRC3	Q13489	604 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	HNF4G	Q14541	408 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LCE1E	Q5T753	118 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	AADACL2	Q6P093	401 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	MYCT1	Q8N699	235 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CCT6B	Q92526	530 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CDT1	Q9H211	546 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RCE1	Q9Y256	329 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	BTBD18	B2RXH4	712 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LDB2	O43679	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LIAS	O43766	372 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	DDAH2	O95865	285 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PRSS2	P07478	247 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FCGR1A	P12314	374 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	BDNF	P23560	247 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GSTM2	P28161	218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SERPINA4	P29622	427 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP3CC	P48454	512 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GXYLT1	Q4G148	440 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	GALNT7	Q86SF2	657 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CUZD1	Q86UP6	607 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FAR1	Q8WVX9	515 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ARRDC3	Q96B67	414 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	HSPB6	O14558	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	AGR2	O95994	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FCGR2A	P12318	317 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	CHN1	P15882	459 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	AMT	P48728	403 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	FOXO1	Q12778	655 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF284	Q2VY69	593 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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