RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TMED1Q13445 227 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INAVAQ3KP66 663 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNSTQ6PJW8 725 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ADCK1Q86TW2 530 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ATL1Q8WXF7 558 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INPP5DQ92835 1189 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HAS1Q92839 578 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SH3GL1Q99961 368 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SEMA3CQ99985 751 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MDM4O15151 490 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KDELR1P24390 212 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RBL1P28749 1068 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PEX19P40855 299 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM60Q495X7 471 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PCID2Q5JVF3 399 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USP12O75317 370 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VIPP01282 170 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CES1P23141 567 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AKT2P31751 481 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RAD23BP54727 409 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ELP6Q0PNE2 266 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OVGP1Q12889 678 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VSTM1Q6UX27 236 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SGTAO43765 313 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PAGE1O75459 146 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PDHA1P08559 390 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COX7A2P14406 83 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC153Q494R4 210 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF711Q9Y462 761 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 WDR47O94967 919 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRNPP04156 253 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H2ABP04908 130 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COPAP53621 1224 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MAXP61244 160 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COPZ1P61923 177 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PPP3CAQ08209 521 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 STARD8Q92502 1023 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TPD52L3Q96J77 140 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NRIP1P48552 1158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DGKGP49619 791 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC5A3P53794 718 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CRYMQ14894 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM69Q86WT6 500 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BSNDQ8WZ55 320 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SEMA4DQ92854 862 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ASF1AQ9Y294 204 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 B2RBV5 119 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CYP3A5P20815 502 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ALAS2P22557 587 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 HNF4AP41235 474 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TTPAP49638 278 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CASP5P51878 434 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 EVX2Q03828 476 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 METTL6Q8TCB7 284 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35C1Q96A29 364 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms