RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533430.5

BBS1-221, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 844 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-221	ENST00000533430	IL12RB1	P42701	662 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	CDKN2B	P42772	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	CDH6	P55285	790 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	SCAP	Q12770	1279 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	GRIK2	Q13002	908 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	TAZ	Q16635	292 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	FUT11	Q495W5	492 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	SNX19	Q92543	992 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	PBK	Q96KB5	322 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	CARD9	Q9H257	536 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	ATRX	P46100	2492 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-221	ENST00000533430	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430		A0A1B0GTW7	788 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	GFRA2	O00451	464 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	KRT7	P08729	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	ACADM	P11310	421 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	GOT1	P17174	413 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	AMPD1	P23109	780 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	SLC6A4	P31645	630 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	KAZN	Q674X7	775 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	RNF34	Q969K3	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	ACACA	Q13085	2346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	KNTC1	P50748	2209 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CREB3	O43889	395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	TSPAN3	O60637	253 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	LRIG2	O94898	1065 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	F9	P00740	461 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	FGG	P02679	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CYBB	P04839	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	EPHX1	P07099	455 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	HLA-E	P13747	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CCR1	P32246	355 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-221	ENST00000533430	CHKA	P35790	457 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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