RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 LEFTY1O75610 366 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ACP1P24666 158 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FLT3P36888 993 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MAN2A1Q16706 1144 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ARTNQ5T4W7 220 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC31Q6UY01 552 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 XYLT1Q86Y38 959 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5C3BQ969T7 300 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 C18orf8Q96DM3 657 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 IL36AQ9UHA7 158 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 BRINP1O60477 761 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PRNPP04156 253 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PRB1P04280 392 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 AKT2P31751 481 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DNA2P51530 1060 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ILKQ13418 452 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RTP5Q14D33 572 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB6CQ53S08 254 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ERICH1Q86X53 443 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 NDST4Q9H3R1 872 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MT-CO3P00414 261 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 F9P00740 461 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP11B1P15538 503 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 VWA3BQ502W6 1294 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MIIPQ5JXC2 388 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM131BQ86XD5 332 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 WASF2Q9Y6W5 498 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PIAS2O75928 621 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 GIMD1P0DJR0 217 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 GABRB2P47870 512 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 BPIFB4P59827 614 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FGL2Q14314 439 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 NEK5Q6P3R8 708 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 Q6ZSR6 202 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DRC7Q8IY82 874 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 OR4C6Q8NH72 309 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMPSTE24O75844 475 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CLCN6P51797 869 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2HP62256 183 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 HS1BP3Q53T59 392 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 EMC1Q8N766 993 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MLKLQ8NB16 471 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RFFLQ8WZ73 363 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf74Q96LT6 269 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 HDAC8Q9BY41 377 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ILVBLA1L0T0 632 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 RAD51BO15315 384 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 NEBLO76041 1014 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 MMEP08473 750 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 GKP32189 559 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ACVRL1P37023 503 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ARF5P84085 180 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP11AP98196 1134 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 BMFQ96LC9 184 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-205ENST00000527952 PRORYQ9H606 182 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms