RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526445.1

PDE4DIP-222, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CREB3	O43889	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GJB3	O75712	270 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HCAR3	P49019	387 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CA9	Q16790	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PARP15	Q460N3	678 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GANC	Q8TET4	914 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	VOPP1	Q96AW1	172 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RNF103	O00237	685 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LAT	O43561	262 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PRNP	P04156	253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NDST2	P52849	883 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	BNC1	Q01954	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SERINC3	Q13530	473 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RASA4B	C9J798	803 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PLK4	O00444	970 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RASA4	O43374	803 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LEFTY1	O75610	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FSBP	O95073	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	IL1R2	P27930	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MAPK8	P45983	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GRIA4	P48058	902 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TAS2R38	P59533	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TPI1	P60174	286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GRIK2	Q13002	908 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PIP4P1	Q86T03	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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