RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A4	O43246	635 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	BNIP3L	O60238	219 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3BP5	O60239	455 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GYPC	P04921	128 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF883	P0CG24	379 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSK	P43235	329 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBASH3A	P57075	661 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHC2	P98077	582 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC20A2	Q08357	652 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA9	Q16790	459 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP44	Q9C0F1	390 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAREM1	Q9H706	876 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARVA	Q9NVD7	372 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNK3	O14649	394 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFNK	Q9P0W0	207 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	NENF	Q9UMX5	172 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0Y8X5	98 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	VILL	O15195	856 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDELR3	O43731	214 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAMP2	O60895	175 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEFTY1	O75610	366 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CER1	O95813	267 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTMS	P20962	102 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMA2	P25787	234 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHB2	P29323	1055 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GK	P32189	559 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	AIF1	P55008	147 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHB	Q15464	509 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARD16	Q5EG05	197 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM69	Q86WT6	500 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAXD	Q8IW45	347 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLPP6	Q8IY26	295 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMCES	Q96FZ2	354 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDAC8	Q9BY41	377 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC32A1	Q9H598	525 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087X0T9	212 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD62	A6NC57	917 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREB3	O43889	395 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRCH4	O75427	683 aa		12.94	□□□□□ -0.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms