RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492182.5

XPO1-222, Transcript of exportin 1, human

TSL 2

Gene XPO1, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-222	ENST00000492182	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		A6NNZ2	444 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ALOX15B	O15296	676 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MED7	O43513	233 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PIAS2	O75928	621 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RHOC	P08134	193 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KRT83	P78385	493 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CDK17	Q00537	523 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CENPC	Q03188	943 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NFATC3	Q12968	1075 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NME3	Q13232	169 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PKP1	Q13835	747 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	WBP1	Q96G27	269 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MED15	Q96RN5	788 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		10.23	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ESPN	B1AK53	854 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		E5RJQ4	531 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		K7ESM1	405 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MCF2L	O15068	1137 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	THAP12	O43422	761 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ENDOD1	O94919	500 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	WISP1	O95388	367 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	FYN	P06241	537 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	GP1BA	P07359	652 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC2A3	P11169	496 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCR1	P32246	355 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CHRNA3	P32297	505 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	USP8	P40818	1118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	FMO5	P49326	533 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DNA2	P51530	1060 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PNOC	Q13519	176 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	STIM1	Q13586	685 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		Q6ZSR6	202 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HORMAD1	Q86X24	394 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	JAML	Q86YT9	394 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARL14	Q8N4G2	192 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LMX1A	Q8TE12	382 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	FRS2	Q8WU20	508 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KAT5	Q92993	513 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MED8	Q96G25	268 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HIC2	Q96JB3	615 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	IL12RB2	Q99665	862 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	USP29	Q9HBJ7	922 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NEMP1	O14524	444 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SCAMP1	O15126	338 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MUSK	O15146	869 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	GRAP2	O75791	330 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF202	O95125	648 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TNFSF15	O95150	251 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ADCY5	O95622	1261 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PRNP	P04156	253 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TGM2	P21980	687 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PRCP	P42785	496 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SGCG	Q13326	291 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NR0B2	Q15466	257 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ISX	Q2M1V0	245 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	FBXL22	Q6P050	247 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	UBR7	Q8N806	425 aa		10.21	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NOX5	Q96PH1	765 aa		10.21	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms