RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.71□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CITO14578 2027 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 VDRP11473 427 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CCDC130P13994 396 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ADCYAP1R1P41586 468 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ITGADQ13349 1161 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PTK2BQ14289 1009 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GPR180Q86V85 440 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TTC30AQ86WT1 665 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LZTR1Q8N653 840 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NETO2Q8NC67 525 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CASP10Q92851 521 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KIF12Q96FN5 646 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HEPHQ9BQS7 1158 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PSAT1Q9Y617 370 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN1O60635 241 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ATE1O95260 518 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CES3Q6UWW8 571 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PQLC3Q8N755 202 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PLD5Q8N7P1 536 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DLG3Q92796 817 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CNPY3Q9BT09 278 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 VPS45Q9NRW7 570 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ENDOD1O94919 500 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NFKBIAP25963 317 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CD300CQ08708 224 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FGD3Q5JSP0 725 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HACE1Q8IYU2 909 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GJD2Q9UKL4 321 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LSM1O15116 133 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PRPSAP2O60256 369 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 METTL18O95568 372 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GJA5P36382 358 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DPP6P42658 865 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ABCG1P45844 678 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SLC26A2P50443 739 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KIZQ2M2Z5 673 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 EML3Q32P44 896 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PCDH19Q8TAB3 1148 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RNF157Q96PX1 679 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WXM4 84 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF12P17014 697 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NR1D2Q14995 579 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FIBCD1Q8N539 461 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NEURL2Q9BR09 285 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HIPK3Q9H422 1215 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CHRNGP07510 517 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SAT1P21673 171 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MPSTP25325 297 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ACADVLP49748 655 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CLCN2P51788 898 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 INCA1Q0VD86 236 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TRAF2Q12933 501 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZBED5Q49AG3 693 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms