RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 RHOAP61586 193 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 NPNTQ6UXI9 565 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 Q6ZVU0 165 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PLPP6Q8IY26 295 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 TTC13Q8NBP0 860 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OR2T3Q8NH03 318 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 FATE1Q969F0 183 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OLFM3Q96PB7 478 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PRSS16Q9NQE7 514 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SEPT3Q9UH03 358 aa18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ENC1O14682 589 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ALOX15BO15296 676 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 NEBLO76041 1014 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MAP3K6O95382 1288 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CD160O95971 181 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 IGSF6O95976 241 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 GSRP00390 522 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 COL9A1P20849 921 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 RENBPP51606 427 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 NRLP54845 237 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF235Q14590 738 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 AADACL2Q6P093 401 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 HMGB4Q8WW32 186 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OR8D1Q8WZ84 308 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PTPRN2Q92932 1015 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.48■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 HACD1B0YJ81 288 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 K7ESF4 209 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MATN3O15232 486 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 BNIP3LO60238 219 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 RAD51Q06609 339 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ADCY2Q08462 1091 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ANGPT1Q15389 498 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CARD16Q5EG05 197 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MARC1Q5VT66 337 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ANO7Q6IWH7 933 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PGBD3Q8N328 593 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 HAUS1Q96CS2 278 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PBKQ96KB5 322 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CD248Q9HCU0 757 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 EBF1Q9UH73 591 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.47■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MCF2LO15068 1137 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MTSS1O43312 755 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 VAV1P15498 845 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 COPAP53621 1224 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 ZBTB16Q05516 673 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 AP1B1Q10567 949 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 XRCC4Q13426 336 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 NOMO1Q15155 1222 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 STK40Q8N2I9 435 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 OR2A12Q8NGT7 310 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MAML1Q92585 1016 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SIPA1Q96FS4 1042 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 LGMNQ99538 433 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 MTG2Q9H4K7 406 aa18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C7orf49-210ENST00000486115 AMACRQ9UHK6 382 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms