RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-210	ENST00000481348	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ETFB	P38117	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	HDAC4	P56524	1084 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TAS2R38	P59533	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TYRO3	Q06418	890 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	STAT4	Q14765	748 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TNFSF14	O43557	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ITGAV	P06756	1048 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FER	P16591	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NXPH1	P58417	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ARF5	P84085	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	OVGP1	Q12889	678 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	OXR1	Q8N573	874 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	LEFTY1	O75610	366 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	LRIG2	O94898	1065 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DKK1	O94907	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ACVRL1	P37023	503 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DNA2	P51530	1060 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SHB	Q15464	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348		A0A1W2PQU0	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	RNF103	O00237	685 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	SLC31A1	O15431	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TEX33	O43247	280 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	PCDH8	O95206	1070 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	RXRG	P48443	463 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-210	ENST00000481348	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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