RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNPP09543 421 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIA4P48058 902 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC26A2P50443 739 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYT12Q8IV01 421 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHACTR4Q8IZ21 702 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLIT3O75094 1523 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP3CAQ08209 521 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL12Q53G59 568 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSMRQ99650 979 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NFICP08651 508 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNA2P20248 432 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YWHAQP27348 245 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAGLUP54802 743 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PFKFB4Q16877 469 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EML3Q32P44 896 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDI2Q5TDH0 399 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR107Q5VW38 600 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTSS1LQ765P7 747 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRSK2Q8IWQ3 736 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACP6Q9NPH0 428 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.38■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WFS1O76024 890 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF286BP0CG31 522 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MARCKSL1P49006 195 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR15P49685 360 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC23Q5W5X9 447 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MZT2BQ6NZ67 158 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP4K3Q8IVH8 894 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POC5Q8NA72 575 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BAP1Q92560 729 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CKMP06732 381 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BMP6P22004 513 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HPCAL1P37235 193 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSTM5P46439 218 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL7BQ6UX53 244 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMA8Q8TAA3 256 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC2A14Q8TDB8 520 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPB41L4BQ9H329 900 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AKAP5P24588 427 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM187BQ17R55 369 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARCQ7LC44 396 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LZTR1Q8N653 840 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHID1Q9BWS9 393 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC4A5Q9BY07 1137 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OPTCQ9UBM4 332 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COX7A2P14406 83 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CASP5P51878 434 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGM3Q08188 693 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT77Q7Z794 578 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IZUMO1Q8IYV9 350 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM81AQ8TBF8 368 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROX1Q92786 737 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTMR9Q96QG7 549 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VAT1Q99536 393 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COG5Q9UP83 839 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LY6KQ17RY6 165 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKAG3Q9UGI9 489 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NFAT5O94916 1531 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB2P25686 324 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC5A9Q2M3M2 681 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB14Q8TBM8 379 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL22Q9GZX6 179 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CATSPERZQ9NTU4 200 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP4B1Q9Y6B7 739 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms