RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FAM187AA6NFU0 413 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 K7EQS6 105 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NPC1O15118 1278 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP9BO43861 1147 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TMCC1O94876 653 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 JCHAINP01591 159 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SRCP12931 536 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DRD1P21728 446 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MMP13P45452 471 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NUMBP49757 651 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NRLP54845 237 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TUBB4BP68371 445 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PTK6Q13882 451 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 E2F5Q15329 346 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C4orf22Q6V702 233 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 JAMLQ86YT9 394 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF567Q8N184 647 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC89Q8N998 374 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 UCMAQ8WVF2 138 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FAM3CQ92520 227 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MGME1Q9BQP7 344 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CD320Q9NPF0 282 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HCN2Q9UL51 889 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MYO10Q9HD67 2058 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 K7ERQ8 282 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TTI1O43156 1089 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RAD51CO43502 376 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IFNB1P01574 187 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KRT14P02533 472 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HLA-DQB2P05538 268 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ENPP2Q13822 863 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF235Q14590 738 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PON2Q15165 354 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C8orf74Q6P047 294 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLPP6Q8IY26 295 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BBS5Q8N3I7 341 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PGBD5Q8N414 524 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FRS2Q8WU20 508 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PAK5Q9P286 719 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LHX3Q9UBR4 397 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MUSKO15146 869 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EGFP01133 1207 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ETS1P14921 441 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CR2P20023 1033 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NNMTP40261 264 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CSNK1DP48730 415 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 STARD6P59095 220 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCINQ13939 588 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PPP1R7Q15435 360 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FBXO43Q4G163 708 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms