RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468105.5

RPP40-204, Transcript of ribonuclease P/MRP subunit p40, human

TSL 2

Gene RPP40, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPP40-204	ENST00000468105	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	OXR1	Q8N573	874 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105		K7ENP7	123 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	EPHB6	O15197	1021 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LTF	P02788	710 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ZBED6	P86452	979 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CDH18	Q13634	790 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	MED8	Q96G25	268 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	MIS12	Q9H081	205 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	MFAP3L	O75121	409 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	VDR	P11473	427 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TACR2	P21452	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CASP14	P31944	242 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PDX1	P52945	283 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CLN3	Q13286	438 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	FGL2	Q14314	439 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	STAT4	Q14765	748 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105		A0A1W2PQU0	124 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105		K7ESM1	405 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	MT-CO1	P00395	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	KRT9	P35527	623 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	JAM2	P57087	298 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	APBA1	Q02410	837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CENPC	Q03188	943 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TAF5	Q15542	800 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105		Q6ZVU0	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	BMF	Q96LC9	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPP40-204	ENST00000468105	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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