RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466606.1

EDEM3-205, Transcript of ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3, human

TSL 3

Gene EDEM3, Length 487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDEM3-205	ENST00000466606	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	STX16	O14662	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	AVPR2	P30518	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606		A6NNC1	897 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SYN3	O14994	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	CHRNB1	P11230	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	GAD2	Q05329	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NPAS1	Q99742	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NOS1	P29475	1434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606		A0A0G2JK05	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SOCS2	O14508	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	IRAK2	O43187	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NEURL1	O76050	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NDUFB8	O95169	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KLRC2	P26717	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	GSTM2	P28161	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TYK2	P29597	1187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	NR4A2	P43354	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ME1	P48163	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PLCD1	P51178	756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ACTR2	P61160	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	RHAG	Q02094	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PMPCA	Q10713	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	COG8	Q96MW5	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	PSMD1	Q99460	953 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EDEM3-205	ENST00000466606	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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