RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC19Q9H756 370 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MEI4A8MW99 385 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ACSL1P33121 698 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 TAS2R40P59535 323 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PDK2Q15119 407 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CSRP2Q16527 193 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CARD16Q5EG05 197 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CALN1Q9BXU9 219 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 VPS45Q9NRW7 570 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.83■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 NUMA1Q14980 2115 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 DFFAO00273 331 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SEMA4FO95754 770 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 CD160O95971 181 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PRNPP04156 253 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SLC1A1P43005 524 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SYT12Q8IV01 421 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TMIEQ8NEW7 156 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 KLC2Q9H0B6 622 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 IL36AQ9UHA7 158 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 FZD4Q9ULV1 537 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 METTL12A8MUP2 240 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF806P0C7X5 589 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ITPKAP23677 461 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 AADATQ8N5Z0 425 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 DYRK4Q9NR20 520 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SARDHQ9UL12 918 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 USP34Q70CQ2 3546 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC72A6NJI9 287 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SPOPO43791 374 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TMCC1O94876 653 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TNNT1P13805 278 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TGM1P22735 817 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SERPINB6P35237 376 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 GSDMDP57764 484 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 MMRN1Q13201 1228 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ODF2Q5BJF6 829 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ARSIQ5FYB1 569 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 AFMIDQ63HM1 303 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PLPP6Q8IY26 295 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 NETO2Q8NC67 525 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 CHST14Q8NCH0 376 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 FAM71BQ8TC56 605 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TSC1Q92574 1164 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 SP110Q9HB58 689 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 TFR2Q9UP52 801 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-202ENST00000460308 J3KR12 359 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms