RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428982.4

SYNGAP1-203, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYNGAP1, Length 4,339 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 CADM3Q8N126 398 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 RNF148Q8N7C7 305 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 CD101Q93033 1021 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM143Q96AN5 459 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 CPQQ9Y646 472 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNGAP1-203ENST00000428982 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 EFNA5P52803 228 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ROR1Q01973 937 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RELL1Q8IUW5 271 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 FAF2Q96CS3 445 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CDH19Q9H159 772 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ARPP19P56211 112 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PRKCQQ04759 706 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CGRRF1Q99675 332 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 C1orf21Q9H246 121 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ACSL4O60488 711 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ALX3O95076 343 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 FGD3Q5JSP0 725 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZBTB33Q86T24 672 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 FBXO27Q8NI29 283 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 C7orf26Q96N11 449 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CDRT15Q96T59 188 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CCNCP24863 283 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 IL12RB1P42701 662 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF560Q96MR9 790 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 AURKAO14965 403 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ALOX15BO15296 676 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LIASO43766 372 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PRPSAP2O60256 369 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 NUAK1O60285 661 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 SERPINB9P50453 376 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CCNIQ14094 377 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RAET1EQ8TD07 263 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GPR88Q9GZN0 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 H0Y626 953 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GK3PQ14409 553 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 HERC3Q15034 1050 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PON2Q15165 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 Q3C1V9 767 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RNF149Q8NC42 400 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MCEEQ96PE7 176 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF347Q96SE7 839 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 COL20A1Q9P218 1284 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 FETUBQ9UGM5 382 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TLK1Q9UKI8 766 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZMPSTE24O75844 475 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC26A2P50443 739 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 OLR1P78380 273 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF699Q32M78 642 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PPM1NQ8N819 430 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 C7orf31Q8N865 590 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LMO3Q8TAP4 145 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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