RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM170AA1A519 330 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KPNA7A9QM74 516 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF487B1APH4 448 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM114B3SHH9 223 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADCY3O60266 1144 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MAN1A2O60476 641 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PEX14O75381 377 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DGAT1O75907 488 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDE5AO76074 875 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ESRRBO95718 433 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GHRHP01286 108 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CAPNS1P04632 268 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SELPP16109 830 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PSMC3P17980 439 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TGM2P21980 687 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA2P25787 234 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 INHBCP55103 352 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A3Q00325 362 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CBX3Q13185 183 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 XKR3Q5GH77 459 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RFX6Q8HWS3 928 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CNDP1Q96KN2 507 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM167AQ96KS9 214 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GCNAQ96QF7 691 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LHX5Q9H2C1 402 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF302Q9NR11 478 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MGAMO43451 1857 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MCM3APO60318 1980 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARID2Q68CP9 1835 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM221A6NGB7 291 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAM159BA6NKW6 160 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 E5RJQ4 531 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 F8VP50 259 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 E2F6O75461 281 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TOM1L1O75674 476 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CRTAMO95727 393 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C8BP07358 591 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KRT3P12035 628 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 COX4I1P13073 169 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TPSB2P20231 275 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ITGAXP20702 1163 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SCNN1BP51168 640 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NRLP54845 237 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LAMC2Q13753 1193 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FLOT2Q14254 428 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HERC3Q15034 1050 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDK2Q15119 407 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NOMO1Q15155 1222 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TPSAB1Q15661 275 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KYQ8NBH2 561 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CGRRF1Q99675 332 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms