RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RTN2O75298 545 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LRIG2O94898 1065 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF883P0CG24 379 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RHOQP17081 205 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP3P21580 790 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ETFBP38117 255 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 MAPKAPK2P49137 400 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CCR5P51681 352 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 PPP2CAP67775 309 aa7.83□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 SCAPQ12770 1279 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CNTN1Q12860 1018 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 KIF19Q2TAC6 998 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-BQ31612 363 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 EFHC2Q5JST6 749 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 AGBL4Q5VU57 503 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RETSATQ6NUM9 610 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP14Q86W24 1093 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FAM72BQ86X60 149 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CNGA4Q8IV77 575 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NAXDQ8IW45 347 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM11Q96F44 468 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A18Q96N87 628 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CNPY3Q9BT09 278 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SPON2Q9BUD6 331 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM5Q9C035 493 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 IL21RQ9HBE5 538 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.83□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.83□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.82□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPC4 97 aa7.82□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 C10orf142B7Z368 130 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LATO43561 262 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SH3BP5O60239 455 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZMPSTE24O75844 475 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PRNPP04156 253 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CTSLP07711 333 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNA3P32297 505 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ACVRL1P37023 503 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PBX1P40424 430 aa7.82□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 CTSKP43235 329 aa7.82□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 AIF1P55008 147 aa7.82□□□□□ -1.16
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SGMS1-201ENST00000361543 SHC2P98077 582 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FOXC1Q12948 553 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TMC6Q7Z403 805 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 VSTM4Q8IW00 320 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.82□□□□□ -1.16
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