RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PCSK7Q16549 785 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PARP15Q460N3 678 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 KDELC1Q6UW63 502 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PLD4Q96BZ4 506 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 AGAP2Q99490 1192 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 FGF18O76093 207 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 CNTFP26441 200 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 RGS9BPQ6ZS82 235 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 CHRNA4P43681 627 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 POU6F1Q14863 301 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 LINC00271P0C7V0 271 aa18.16■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 MPP3Q13368 585 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.16■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.16■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 ZBP1Q9H171 429 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.16■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 TSPAN3O60637 253 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 F11P03951 625 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 STRA8Q7Z7C7 330 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 FIBCD1Q8N539 461 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 SLC22A12Q96S37 553 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 CPNE1Q99829 537 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 VPS11Q9H270 941 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PLLPQ9Y342 182 aa18.15■□□□□ 0.5
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