RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327443.8

SP1-201, Transcript of Sp1 transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SP1, Length 2,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1-201ENST00000327443 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DYRK3O43781 588 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 STBD1O95210 358 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 LRPAP1P30533 357 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SERPINB1P30740 379 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SQLEQ14534 574 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAPK11Q15759 364 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CCL15Q16663 113 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DUSP7Q16829 419 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PCGF5Q86SE9 256 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ACDQ96AP0 544 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TXNDC15Q96J42 360 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CEP19Q96LK0 163 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SEPT3Q9UH03 358 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FZD1Q9UP38 647 aa9.97□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ASTN1O14525 1302 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 A0A0X1KG70 313 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 F8W810 466 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PDHXO00330 501 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 IFNA14P01570 189 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC10A3P09131 477 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ITGALP20701 1170 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 HOXC13P31276 330 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 OPRL1P41146 370 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NPEPPSP55786 919 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ARL4CP56559 192 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC25A3Q00325 362 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 GRB14Q14449 540 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZNF677Q86XU0 584 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TRIB2Q92519 343 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TTC9Q92623 222 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TTC25Q96NG3 672 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 REEP2Q9BRK0 252 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CHID1Q9BWS9 393 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PARP2Q9UGN5 583 aa9.96□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 GREM1O60565 184 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CCNE2O96020 404 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 HTR2BP41595 481 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 TSPAN7P41732 249 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 ACOT2P49753 483 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CDK10Q15131 360 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 SLC18A3Q16572 532 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 METTL7BQ6UX53 244 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 SENP1Q9P0U3 644 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 NUP50Q9UKX7 468 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 A0A0G2JMP0 313 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 I3L4J1 428 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 PDPK1O15530 556 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 CDH16O75309 829 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 KCNH1O95259 989 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 IGHA2P01877 340 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 MYL2P10916 166 aa9.95□□□□□ -0.82
SP1-201ENST00000327443 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms