RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM54-201ENST00000296098 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.34■■□□□ 1.49
TRIM54-201ENST00000296098 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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TRIM54-201ENST00000296098 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF280DQ6N043 979 aa24.32■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.32■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa24.32■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 EFEMP1Q12805 493 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 NOGQ13253 232 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 RAPH1Q70E73 1250 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.31■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.31■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.31■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM114B3SHH9 223 aa24.3■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.3■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 GPR152Q8TDT2 470 aa24.3■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.3■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.29■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 PAMP19021 973 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 RANBP10Q6VN20 620 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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