RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-EP13747 358 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 COL9A1P20849 921 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCNCP24863 283 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL12P48061 93 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DGKEP52429 567 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SATB1Q01826 763 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NOMO1Q15155 1222 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DLG2Q15700 870 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PLPP6Q8IY26 295 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF366Q8N895 744 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MAML1Q92585 1016 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LRFN3Q9BTN0 628 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FBRSQ9HAH7 460 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FANCMQ8IYD8 2048 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 K7ESF4 209 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CES2O00748 559 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SIN3BO75182 1162 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HOXA6P31267 233 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 XRCC4Q13426 336 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf210Q8IVY1 113 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC13Q8IYE1 715 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CAMKK1Q8N5S9 505 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TTC13Q8NBP0 860 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ACTL9Q8TC94 416 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PBKQ96KB5 322 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MTG2Q9H4K7 406 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SNX12Q9UMY4 172 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HACD1B0YJ81 288 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MATN3O15232 486 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FANCGO15287 622 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ALOX15BO15296 676 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LAMTOR5O43504 91 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GSRP00390 522 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 VAV1P15498 845 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRLRP16471 622 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TCP1P17987 556 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CXCR5P32302 372 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 COPAP53621 1224 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ETF1P62495 437 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LBRQ14739 615 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CYTH1Q15438 398 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ACCSLQ4AC99 568 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC181Q5TID7 509 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZVU0 165 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 RASSF3Q86WH2 238 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TEX26Q8N6G2 289 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T3Q8NH03 318 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HAUS1Q96CS2 278 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC114Q96M63 670 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PSKH2Q96QS6 385 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL9Q96SU4 736 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LGMNQ99538 433 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LHX3Q9UBR4 397 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT3Q9UH03 358 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MCF2LO15068 1137 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CEP104O60308 925 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 APBB3O95704 486 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TDGF1P13385 188 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CARD16Q5EG05 197 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MARC1Q5VT66 337 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 BBS5Q8N3I7 341 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CCNYQ8ND76 341 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 OR2AP1Q8NGE2 309 aa13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms