RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CLUHO75153 1309 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC166P0CW27 439 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PBX1P40424 430 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PFKFB4Q16877 469 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HMG20AQ9NP66 347 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DYTNA2CJ06 578 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ERBB2P04626 1255 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MYL12AP19105 171 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF3Q13114 568 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MBOAT7Q96N66 472 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CYLDQ9NQC7 956 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ARL15Q9NXU5 204 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 H3BN98 237 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 IFNGR2P38484 337 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ACVR2BQ13705 512 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ALFQ53S48 1182 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA6P08185 405 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ2P63252 427 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PLCL1Q15111 1095 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ASNA1O43681 348 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NFICP08651 508 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM50BQ9Y247 325 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD2Q9Y426 696 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PSME3P61289 254 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HYIQ5T013 277 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MLYCDO95822 493 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FGFR1P11362 822 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 WDR48Q8TAF3 677 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GAD1Q99259 594 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DIABLOQ9NR28 239 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NFKB1P19838 968 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA4P29622 427 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GRIA4P48058 902 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PPIL2Q13356 520 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FGD3Q5JSP0 725 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PROX1Q92786 737 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM38O00635 465 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MYL12BO14950 172 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PAX7P23759 505 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ABCG1P45844 678 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GSTA3Q16772 222 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TEKT5Q96M29 485 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf50Q9BV19 199 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PIPSLA2A3N6 862 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CATP04040 527 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA5P08758 320 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MTFR1LQ9H019 292 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CDT1Q9H211 546 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 19.6
CCSAP-201ENST00000284617 CRADDP78560 199 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NRF1Q16656 503 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms