RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC28BQ9BUN5 200 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CHADO15335 359 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 BANF1O75531 89 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MICAL2O94851 1124 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PDHA1P08559 390 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT3P12035 628 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX19P40855 299 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF10Q12962 218 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 DPYSL3Q14195 570 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PKDCCQ504Y2 493 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf163Q5TEZ5 329 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC8Q6A555 127 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF14Q92915 247 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRN2Q92932 1015 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF197O14709 1029 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN9O14815 690 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K7O43318 606 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LRCH4O75427 683 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB4P48594 390 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF10P55107 478 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PARM1Q6UWI2 310 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGZQ86VD9 579 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A11Q86WA9 606 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFAND2BQ8WV99 257 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX264Q9Y6I9 313 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PATJQ8NI35 1801 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA13PA6NCF6 341 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM24O75264 130 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 GABBR2O75899 941 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM63AO94886 807 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MFN1Q8IWA4 741 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3R2O00459 728 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FCHO1O14526 889 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT37O76014 449 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF135Q8IUD6 432 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A12Q96S37 553 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2S1Q96SQ9 504 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 COPEO14579 308 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PGM1P36871 562 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 DBN1Q16643 649 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAL1Q4LDG9 190 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR158Q5T848 1215 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 RINLQ6ZS11 566 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LEMD2Q8NC56 503 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM111AQ96PZ2 611 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SIKE1Q9BRV8 207 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM192AQ9GZU8 254 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 WWP1Q9H0M0 922 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 IL37Q9NZH6 218 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf78A6NCI8 922 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8RI6L899 631 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QYV0 167 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL2P10916 166 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ELK3P41970 407 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS7P49802 495 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNLT1P63172 113 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD6Q8NC69 237 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKT4Q8WW24 435 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MTBPQ96DY7 904 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SERAC1Q96JX3 654 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZWILCHQ9H900 591 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK12Q9HB15 430 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PDP2Q9P2J9 529 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT36O76013 467 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 YWHAQP27348 245 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 GAD2Q05329 585 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms