RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 LUZP2Q86TE4 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EGFRP00533 1210 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SERPINA6P08185 405 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 BEX3Q00994 111 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TLK2Q86UE8 772 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 WDR48Q8TAF3 677 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SNX15Q9NRS6 342 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ARL15Q9NXU5 204 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 OPTCQ9UBM4 332 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 VAV3Q9UKW4 847 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GSC2O15499 205 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FGD3Q5JSP0 725 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 HYIQ5T013 277 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SPESP1Q6UW49 350 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 STK39Q9UEW8 545 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 BTRCQ9Y297 605 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CXCL11O14625 94 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FFAR3O14843 346 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GPR42O15529 346 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 URODP06132 367 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF410Q86VK4 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CDCA5Q96FF9 252 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZFP42Q96MM3 310 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF670Q9BS34 389 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP7B1O75881 506 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 C2P06681 752 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FGRP09769 529 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ALFQ53S48 1182 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF276Q8N554 614 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 P2RY11Q96G91 374 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CPXM1Q96SM3 734 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 APOL4Q9BPW4 351 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ADM5C9JUS6 153 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CAPZA2P47755 286 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 INAQ16352 499 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PACS1Q6VY07 963 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CLDN5O00501 218 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 KRT20P35900 424 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MFSD10Q14728 455 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PTPRNQ16849 979 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SETD9Q8NE22 299 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EXOC2Q96KP1 924 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FCGRTP55899 365 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GBE1Q04446 702 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms