RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MB	P02144	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ITGB3	P05106	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NRG3	P56975	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAPK11	Q15759	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		M0R036	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AGR2	O95994	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NTRK1	P04629	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CKM	P06732	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CPE	P16870	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINB4	P48594	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CBLB	Q13191	982 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCNA10	Q16322	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GSTA2	P09210	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	JAK1	P23458	1154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TAZ	Q16635	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ING2	Q9H160	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AREL1	O15033	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TAC1	P20366	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EDNRB	P24530	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PTPN9	P43378	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FMO5	P49326	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FXN	Q16595	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	USP51	Q70EK9	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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