RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629992.2

PLCB1-218, Transcript of phospholipase C beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLCB1, Length 3,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1-218ENST00000629992 CNGA3Q16281 694 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 TMEM198Q66K66 360 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 16.1
PLCB1-218ENST00000629992 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 PSMD5Q16401 504 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 C17orf99Q6UX52 265 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 RELL1Q8IUW5 271 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 TTC1Q99614 292 aa14.59□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 J3KR12 359 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 PAGE1O75459 146 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 PTPN9P43378 593 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 NEK3P51956 506 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 SLC5A3P53794 718 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 CCDC6Q16204 474 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 FICDQ9BVA6 458 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 EMCNQ9ULC0 261 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.58□□□□□ -0.07
PLCB1-218ENST00000629992 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 BLMHQ13867 455 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 LPIN1Q14693 890 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 UPP1Q16831 310 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 RGMBQ6NW40 437 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SCLYQ96I15 445 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 CHST12Q9NRB3 414 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 COL1A2P08123 1366 aa14.58□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 STX3Q13277 289 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 RNF220Q5VTB9 566 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 NXNQ6DKJ4 435 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TDRPQ86YL5 185 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 GPR39O43194 453 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SPATA31D3P0C874 917 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 CCL23P55773 120 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 NME5P56597 212 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PPME1Q9Y570 386 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 HAS3O00219 553 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 GCATO75600 419 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 KCNE1P15382 129 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SERPINB5P36952 375 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 ALFQ53S48 1182 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 HSFY1Q96LI6 401 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 NT5MQ9NPB1 228 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SNX15Q9NRS6 342 aa14.57□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 A8MX80 341 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 DPYSL4O14531 572 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 IRF1P10914 325 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.084e-7■■■□□ 14.7
PLCB1-218ENST00000629992 ACAP1Q15027 740 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 MCUQ8NE86 351 aa14.56□□□□□ -0.08
PLCB1-218ENST00000629992 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms