RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 E7ENQ6 273 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CD27P26842 260 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GPD2P43304 727 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX26Q7Z412 305 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH1Q86X53 443 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HES6Q96HZ4 224 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PBKQ96KB5 322 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP85Q9BW27 656 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MTG2Q9H4K7 406 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNA2O75051 1894 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WV48 116 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RRM1P23921 792 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A1P43005 524 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRB2P47870 512 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB16Q05516 673 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRF1Q5T601 910 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 BSPRYQ5W0U4 402 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MBLAC2Q68D91 279 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 EDEM1Q92611 657 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG6Q9Y672 507 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 LATS1O95835 1130 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-27P01718 113 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CD70P32970 193 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GRK6P43250 576 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT8P50990 548 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX16P57768 344 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MAMLD1Q13495 774 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TEAD4Q15561 434 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PKDCCQ504Y2 493 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PASD1Q8IV76 773 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 AHI1Q8N157 1196 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD6Q9BX69 1037 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 FBRSQ9HAH7 460 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 EBF2Q9HAK2 575 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SERGEFQ9UGK8 458 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 FSBPO95073 299 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 FTCDO95954 541 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A4P31645 630 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 IL9RQ01113 521 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ADIGQ0VDE8 80 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CREG2Q8IUH2 290 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAT1P54687 386 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SHBQ15464 509 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS13Q6UX07 377 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SCML4Q8N228 414 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 C18orf8Q96DM3 657 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SGK2Q9HBY8 427 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GTQ1 180 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1FO00160 1098 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT1P04628 370 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCRHP07919 91 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf20Q8ND61 904 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 UBA3Q8TBC4 463 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 HESX1Q9UBX0 185 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DNTTP04053 509 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE8P0CG41 777 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN1A1P33908 653 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms