RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622090.4

DDB2-215, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene DDB2, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-215	ENST00000622090	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	BLACE	A4D250	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	AGRP	O00253	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090		O00370	1275 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PLD2	O14939	933 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CALCA	P01258	141 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TACR2	P21452	398 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SYT1	P21579	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NNMT	P40261	264 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PLK1	P53350	603 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	STK38	Q15208	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DLG2	Q15700	870 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TAC4	Q86UU9	113 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CHSY1	Q86X52	802 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TFAP2B	Q92481	460 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	BOC	Q9BWV1	1114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MAPK13	O15264	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SPTLC2	O15270	562 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ALOX15B	O15296	676 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	LIPC	P11150	499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SFTPC	P11686	197 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CD19	P15391	556 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ZNF18	P17022	549 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	C1orf61	Q13536	156 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SPIDR	Q14159	915 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PARG	Q86W56	976 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090		K7ERQ8	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PPP6R2	O75170	966 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PCDH8	O95206	1070 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MT-CO1	P00395	513 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SETSIP	P0DME0	302 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	JUND	P17535	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ITIH1	P19827	911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	NR2F2	P24468	414 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ETV5	P41161	510 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	INHBC	P55103	352 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CENPC	Q03188	943 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SERINC3	Q13530	473 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MANEA	Q5SRI9	462 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KRT39	Q6A163	491 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	UBR7	Q8N806	425 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MIS12	Q9H081	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	PISD	Q9UG56	409 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDB2-215	ENST00000622090	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms