RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PLD5Q8N7P1 536 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 MAML1Q92585 1016 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 F5P12259 2224 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 NHLH1Q02575 133 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DPYSL2Q16555 572 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 MIB1Q86YT6 1006 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DMDP11532 3685 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 APOL1O14791 398 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 GJA4P35212 333 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA9P43362 315 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC38Q502W7 563 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 STRADAQ7RTN6 431 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PQLC3Q8N755 202 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CLDN23Q96B33 292 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 USP34Q70CQ2 3546 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM120BA0PK00 339 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 GCAP28676 217 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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SGMS1-210ENST00000619438 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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SGMS1-210ENST00000619438 C4orf22Q6V702 233 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 RNF139Q8WU17 664 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 USP29Q9HBJ7 922 aa22.04■■□□□ 1.12
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SGMS1-210ENST00000619438 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SGMS1-210ENST00000619438 QPCTQ16769 361 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 NPNTQ6UXI9 565 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4X1Q8N118 509 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF276Q8N554 614 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SENP1Q9P0U3 644 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PAK5Q9P286 719 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.02■■□□□ 1.12
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SGMS1-210ENST00000619438 PHBP35232 272 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SLC18A1P54219 525 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 COG7P83436 770 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 FZD5Q13467 585 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 OTUB2Q96DC9 234 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.127e-6■■□□□ 13.7
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SGMS1-210ENST00000619438 E7ENQ6 273 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 LAMTOR5O43504 91 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0754O94854 1291 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 L1CAMP32004 1257 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 GALK1P51570 392 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 XRCC4Q13426 336 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DHCR24Q15392 516 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CA9Q16790 459 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 EFHC2Q5JST6 749 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.01■■□□□ 1.11
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